アミノ酸同士が結合するときに取る形のひとつ。１つのアミノ酸のカルボキシル基（-COOH）と、ほかのアミノ酸のアミノ基（-NH₂）が脱水縮合（注）してできる。このペプチド結合によってできるのがペプチドという化合物で、２つつながるとジペプチド、３つつながるとトリペプチド、多数つながったものはポリペプチドと呼ばれることが多い。タンパク質も基本的にこの結合によってできる。結合力がとても強く、分解するには強酸か強アルカリが必要。しかし生物の体内には体温程度の温度とpH７程度の環境でも素早くペプチド結合を分解する酵素がある。（例：ペプチダーゼ、プロテアーゼなど）

注：脱水縮合とは、化合物のなかの２つ以上の分子が反応し、そこから水（H₂O）が取れ、その他の部分がつながって新しい化合物ができる反応のこと